История Сихотэ-Алинского заповедника началась с «Колумба Дальнего Востока» Владимира Клавдиевича Арсеньева. Именно он, в ходе своих экспедиций в 1902-1910 годах, впервые описал и открыл миру уникальную природу удивительного края – Среднего Сихотэ-Алиня. Отмечая редкое сочетание представителей южной и северной флоры и фауны, невероятное разнообразие растительного и животного мира, Арсеньев назвал эту горную страну «Великий лес». Именно его описания обратили внимание ученых и натуралистов со всего мира на Средний Сихотэ-Алинь.
Уже тогда, в начале XX столетия, Российское государство озаботилось резким снижением численности соболя из-за хищнической охоты за пушниной. Тревогу забили не только охотники и ученые, но и государственные чиновники, правительство, ведь страна теряла один из основных доходов.
Ученые снарядили несколько «соболиных» экспедиций по Дальнему Востоку и Сибири, чтобы создать охраняемые резерваты – заповедники, и спасти животное от полного истребления. С этой целью на Средний Сихотэ-Алинь была направлена исследовательская экспедиция под руководством охотоведа Константина Георгиевича Абрамова и зоолога Юрия Александровича Салмина. Обследовав леса этого района, они предоставили убедительное обоснование для создания не только соболиного, а комплексного заповедника на Сихотэ-Алине «для восстановления типичной южно-уссурийской фауны и флоры». Они же уточнили и предложили на утверждение границы заповедника. Именно благодаря огромной работе двух выдающихся ученых идея о создании заповедника была реализована. Так, 10 февраля 1935 года был создан Сихотэ-Алинский заповедник, территория которого включала площадь в 1 млн. га с охранной зоной 0,7 млн. га.
Константин Абрамов был назначен первым директором заповедника, а Юрий Салмин стал его заместителем. К ним присоединились ученые: Лев Капланов, Гордей Бромлей, Константин Грунин, Валентин Шамыкин, Борис Колесников, Алексей Куренцов, Юрий Ливеровский. В самые тяжелые первые годы становления эти люди заложили прочный фундамент для развития заповедника. Результатом их слаженной работы стало существенное увеличение территории заповедника – с 1944 года площадь заповедника без охранной зоны составляла уже 1,8 млн. га. В то время это был крупнейший заповедник на планете.
К сожалению, в 1951 году, на волне гонений на заповедную систему, многие заповедники страны были закрыты, площадь Сихотэ-Алинского заповедника сокращена в 18 раз – до 100 тыс. га. Впоследствии пришлось приложить немало усилий, чтобы вновь расширить заповедную территорию.
Заповедник довольно быстро выполнил свою главную задачу – сохранение соболя. Особо охраняемая природная территория, существовавшая в довоенные годы, охватывала большую часть этих остаточных очагов. Частичное слияние небольших изолированных популяций произошло уже к середине 40-х годов, а к началу 50-х запасы соболя в заповеднике и местами на пограничных с ним участках достигли промыслового уровня. С 1941 года в Приморье был введен лимит на промысел соболя. С целью ускорить его расселение и рост численности в 50-е годы широко развернулись работы по выпуску привозных соболей. Зверьков выпускали и на западном макросклоне хребта Сихотэ-Алинь в Красноармейском районе.
В начале 60-х годов соболь заселил практически все глубинные участки Среднего Сихотэ-Алиня, а по реке Серебрянке и на севере района по реке Самарга впервые после долголетнего перерыва достиг морского побережья. 70-е годы характеризуются как период окончательного заселения соболем всех пригодных для его обитания мест в заповеднике и его окрестностях.
Одновременно с реализацией миссии по спасению соболя от исчезновения Сихотэ-Алинский заповедник обретает новое значение – охрана и изучение амурского тигра. Именно здесь в 1930-1940-е годы зародилась идея о необходимости охраны амурского тигра, ранее считавшемся «вредным». В эти кризисные для популяции годы здесь сохранился самый крупный очаг обитания тигра, послуживший ядром для последующего восстановления численности хищника.
Тогда же зоолог Лев Капланов провел на территории заповедника первый на Дальнем Востоке учет тигра, в результате которого стало известно о бедственном положении животных – в России осталось не более 30-40 особей амурского тигра. Капланов первым заговорил о необходимости охраны хищника. Предложенные им меры – запрет на добычу взрослых тигров и отлов молодняка по всему Дальнему Востоку – были приняты в 1947 и 1956 годах соответственно. Эти действия позволили сохранить популяцию амурского тигра от полного истребления.
Первый директор заповедника Константин Абрамов разработал методику ежегодных учетов тигра по следам, которая и по сей день остается самым эффективным инструментом среди зоологов для учета единственного снежного тигра в мире.
Сихотэ-Алинский заповедник до сих остается одним из главных центров изучения амурского тигра. В 1992 году здесь стартовал совместный проект заповедника и Института диких животных Хорнокера, позднее Общества сохранения диких животных (США). Российско-американский проект ознаменовал начало нового этапа в изучении подвида с помощью использования телеметрии. За двадцать с лишним лет слежения за радио-, а затем GPS-меченными особями были получены ответы на важные вопросы: чем болеют тигры, куда расселяется молодняк, на кого предпочитают охотиться тигры, как часто у тигрицы появляется потомство, как долго тигрята остаются с матерью и многие другие.
В 2006 года сотрудники заповедника впервые использовали фоловушку для наблюдения за местной группировкой тигров, заложив таким образом устойчивую программу мониторинга. Теперь ученые знают каждого тигра «в лицо» - как постоянных резидентов, так и полосатых гостей.
Вклад Сихотэ-Алинского заповедника в изучение и охрану амурского тигра получил признание и на международном уровне. В год своего 80-летия заповедник получил аккредитацию CA|TS – наивысшее признание от мировой общественности за усилия по сохранению тигра, став первой в России и второй в мире (после непальского национального парка "Читван") особо охраняемой природной территорией, прошедшей сертификацию тигриных местообитаний.
Сегодня Сихотэ-Алинской заповедник продолжает играть большую роль в восстановлении амурского тигра. Именно здесь находится ядро популяции, охватывающей Центральный Сихотэ-Алинь. В настоящее время это крупнейший заповедник в ареале амурского тигра.
Первозданные ландшафты и многообразие животного и растительного мира определили статус Сихотэ-Алинского заповедника как ключевой природоохранной территории не только на Дальнем Востоке, но и в мире. В 1979 году Сихотэ-Алинский заповедник получил статус биосферного, а затем был включен в список Всемирного наследия ЮНЕСКО.
В настоящее время территория заповедника составляет 401600 га и включает 2900 га акватории Японского моря. Площадь охранной зоны - 67660 га. Заповедник расположен на территории Тернейского муниципального округа, Красноармейского района и Дальнегорского городского округа.